Jak Wytresować Smoka 3 skupia się się na społeczności ludzi i smoków, które żyją ze sobą w zgodzie, aż do momentu, gdy Szczerbatek trafia na ślad tajemniczego stwora. Rozpocznie to serię zdarzeń mogących doprowadzić do ponownej wojny, której chce zapobiec Czkawka.

Harry Rosenberg, wzięty nowojorski kardiolog, znużony i rozczarowany dotychczasowym życiem rzuca wszystko i jedzie do Izraela… hodować świnie. Zostawia swoją praktykę, wiecznie studiującą córkę Annabelle, syna Dawida, który ku przerażeniu ojca jest gejem i byłą żonę, którą niegdyś tak kochał. Tymczasem w Izraelu miejscowy rabin Mosze Cattan jest zdeklarowanym przeciwnikiem jego niekoszernej świńskiej farmy. Lecz - o ironio! - to właśnie ten człowiek pomoże mu uporać się rodzinnymi problemami i na nowo odkryć sens życia.